Si è poi specializzato, con Laurea Magistrale, presso l’Università di Pisa, in Cooperazione allo sviluppo, Mediazione e trasformazione dei conflitti, con una tesi dal titolo: “Progettare percorsi di Mediazione”.
Ha progettato e realizzato diversi percorsi formativi riguardanti i temi della comunicazione, della gestione delle emozioni e del conflitto e della mediazione, rivolti a scuole elementari, medie e superiori a livello locale e nazionale.
Sugli stessi temi ha svolto attività di formazione per associazioni del terzo settore a livello locale e nazionale.
Ha progettato un percorso formativo sulla gestione del conflitto rivolto agli agenti di Polizia Municipale del Comune di Cascina, dove nel 2003 ha progettato e gestito uno Sportello comunale di Mediazione sociale.
Recentemente ha progettato e dato vita al Centro per la Mediazione dei Conflitti presso la SVS di Livorno.
Collabora, inoltre, con il Centro Interuniversitario di Studi sul Servizio Civile, con attività di ricerca e formazione.
Dal 2010 è Mediatore civile e commerciale accreditato presso il Ministero della giustizia e dal 2011 è formatore per Enti accreditati presso il Ministero della giustizia sulla medesima materia.

-    Croce Flavio, Ricognizione delle esperienze più significative in materia di difesa civile non armata e nonviolenta in ambito nazionale, europeo e internazionale, ricerca commissionato dalla Presidenza del Consiglio dei ministri – Ufficio nazionale per il servizio civile, 2008.
-    Croce Flavio, Progetto di mediazione multiparte “Voglia di dialogo a S. Andrea”, dagli Atti del Convegno Nazionale “Interagendo-Spazi di confronto delle Mediazioni”, a cura di M. Ferrara, C. Pucciarelli, C. Troisi – Sellino Editore, Avellino, 2007.
-    Croce Flavio, in Mediazione e conciliazione. Ambiti applicativi e modalità di svolgimento di una nuova professione, (a cura di) Paolo S. Nicosia, Damiano Marinelli, Alessandro Bruni - Edizioni Plus, Pisa, 2004.